სატრანსპორტო სისტემებისა და მექანიკის ინჟინერიის ფაკულტეტზე ფუნქციონირებს ორი ძირითადი ლაბორატორია, რომელიც სრულად ემსახურება ფაკულტეტზე მიმდინარე პრაქტიკული სწავლებისა და კვლევების პროცეს და აერთიანებს შემდეგ ქვე მიმართულებებს:

• "საავტომობილო ტრანსპორტის და ლოჯისტიკის სასწავლო ლაბორატორია“;
• "სარკინიგზო ტრანსპორტის სასწავლო ლაბორატორია - სიმულატორი“;
• „ვაგონების კონსტრუქციების და რემონტის ტექნოლოგიის სასწავლო ლაბორატორია“;
• „სარკინიგზო ავტომატიკის, ტელემექანიკის და კავშირგაბმულობის ლაბორატორია“;
• „ურთიერთშეცვლადობის, სტანდარტიზაციისა და ტექნიკური გაზომვების ლაბორატორია“;
• რობოტებისა და რობოტო-ტექნიკის ლაბორატორია;
• „სატყეო-ტექნიკური ლაბორატორია“;
• „მანქანათა ნაწილების და ამწე-სატრანსპორტო მანქანების ლაბორატორია“;
• „სამაცივრო ტექნოლოგიების ლაბორატორია“;
• „ტექნოლოგიური მოწყობილობების და საწარმოო პროცესების ლაბორატორია“;
• „საწვავ-საცხი მასალების ტესტირების ლაბორატორია“.

ლაბორატორიები აღჭურვილია  სხვადასხვა სახის, როგორც უნივერსალური, აგრეთვე ნახევრადავტომატური რთული კინემატიკური სტრუქტურის მქონე კბილდამამუშავებელი ჩარხებით; პროგრამული მართვის საჩარხო სისტემებით; საწარმოო რობოტებით და კომპიუტერული მართვის მქონე მოწყობილობებით; საწარმოო ტექნოლოგიური აღჭურვილობით და შესაბამისი საკვლევი და ლაბორატორიული მზომი ტექნიკით; ჰიდრო და პნევნო-ამძრავების ცალკეული მოქმედი მოდულებით და ელემენტებით; ჰიდრო, ელექტროჰიდრო და ელექტრომექანიკური სისტემებით აღჭურვილი მოქმედი დანადგარებით; მექანიკური ამძრავების დინამიკური კვლევის ლაბორატორიული დანადგარებით; საკვლევი მზომი მოწყობილობებით და ხელსაწყოებით, მართვისა და რეგულირების ელემენტების პარამეტრების (ელექტრომოწყობილობების) სარეგისტრაციო ტექნიკით; სიმულატორებით.

• ტრანსპორტის სასწავლო-სამეცნიერო და საექსპერტო ლაბორატორია 1
• მანქანათმშენებლობის სასწავლო-სამეცნიერო და საექსპერტო ლაბორატორია 2